Патыка, Н. В. Оценка метагенома и детекция функционально значимых полиморфизмов прокариот почвы с использованием метода пиросеквенирования [Текст] / Н. В. Патыка, А. Ю. Колодяжный, И. И. Ибатуллин> // Мікробіол. журн. - 2016. - Т. 78, № 2. - С. 43-51 MeSH-головна: ПОЧВЫ МИКРОБИОЛОГИЯ -- SOIL MICROBIOLOGY МЕТАГЕНОМ -- METAGENOME ПРОКАРИОТНЫЕ КЛЕТКИ -- PROKARYOTIC CELLS Анотація: В работе проведена оценка метагенома и функционально значимых филогенетических и таксономических полиморфизмов прокариот в черноземе типичном под пшеницей озимой с использованием метода пиросеквенирования. Было выявлено 1708 операционных таксономических единиц и 335 таксонов прокариот. Установлено, что в структуре метагенома прокариот чернозема типичного были представители 2 архейных и 22 бактериальных фил, абсолютные доминанты относились к Proteobacteria – 79,6 % и Actinobacteria – 12,9 %. Полиморфизм представленности прокариотных таксонов наблюдали на уровне семейств; доминирующими при этом были: Alcaligenaceae, Pseudomonadaceae, Solirubrobacteraceae, Gaiellaceae, Nitrososphaeraceae. Показано филогенетические связи между основными представителями метагенома прокариот, сформировавшиеся в черноземе типичном агроценоза пшеницы озимой. Таким образом, использование метода пиросеквенирования, кроме оценки структуры и разнообразия, открывает перспективы для исследования функциональной составляющей метагенома прокариот почвы. Дод.точки доступу: Колодяжный, А. Ю. Ибатуллин, И. И. Вільних прим. немає |