Shlyakhovenko, V. O.     NF-kB-p50-TFBS-complementary and c-myc-TFBS-complementary motifs in msRNAs involved in pathogenesis of dsfferent lympho- and myeloproliferative diseases [Text] = Мотиви, комплементарні сайтам зв’язування факторів транскрипції NF-kB-p50 та c-myc, в мІРНК, залучених до патогенезу декількох лімфо- та мієлопроліферативних захворювань / V. O. Shlyakhovenko, O. A. Orlovsky, O. A. Samoylenko // Клиническая онкология. - 2018. - Том 8, N 1. - P18-23. - Библиогр. в конце ст. MeSH-головна: ЛИМФОПРОЛИФЕРАТИВНЫЕ НАРУШЕНИЯ -- LYMPHOPROLIFERATIVE DISORDERS МИЕЛОПРОЛИФЕРАТИВНЫЕ НАРУШЕНИЯ -- MYELOPROLIFERATIVE DISORDERS МИКРО-РНК -- MICRORNAS ДИАГНОСТИКА ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ -- DIAGNOSIS, DIFFERENTIAL Анотація: In our previous works, there were discovered different kinds of the c-myc-TFBS-complementary and NF-kB-p50-TFBS-complementary motifs in the stem-loop forms of the human, mouse and rat miRNAs. Also, there were described different types of the stem-loop miRNA informational redundancy as to these motifs. We have hypothesized these motifs, being the elements of the stem-loop miRNA degradome, can function as the alternative transcription factors. In the present paper, this methodology was applied to analysis of the characteristic miRNA expression profiles of different B-lymphoproli­ferative and myeloproliferative diseases. There were found the following main regularities: 1) significant part of the stem-loop miRNAs involved in pathogenesis of different hematologic diseases contain complementary motifs to the binding sites of c-myc and NF-kB-p50 transcription factors. Agreeably to this, the degradome elements of these stem-loop miRNAs are potentially able to function as alternative transcription factors; 2) each nosological unit has its own characteristic spectra of the TFBS-complementary motifs in its characteristic miRNA set, showing their real participation in the cell differentiation pathways; 3) different types of the stem-loop miRNA informational redundancy as to the TFBS-complementary motifs correlate with different directions of the cell differentiation. Also, our results permit to formulate the following recommendations for the differential diagnosis: 1) hyperexpression of miR-320a and miR-323b in the leukemia cells may be a weighty argument to diagnose chronic myelocytic leukemia (CML); 2) hyperexpression of the miRs 495 and 543 — alone and, moreover, in combination with hypoexpression of such miRs as 134, 542, 623, 671, 1182 — in the leukemia cells may be a weighty argument to diagnose CML; 3) hypoexpression of the miR-126 in the leukemia cells may be a weighty argument to diagnose acute myelocytic leukemia; 4) hyperexpression of the miR-185 and miR-324 in the lymphoma cells may be a weighty argument to diagnose Burkitt’s lymphoma; 5) hyperexpression of the miR-192a-2 in the lymphoma cells may be a weighty argument to diagnose mantle-cell lymphoma У наших попередніх дослідженнях у складі пре-міРНК (stem-loop форм) людини, миші і щура виявлено різні типи мотивів, комплементарних сайтам зв’язування факторів транскрипції (ФТ) c-myc та NF-kB-p50. Також описано різні типи інформаційної надлишковості пре-міРНК щодо таких мотивів. Сформульована гіпотеза, що такі мотиви, будучи елементами деградому пре-міРНК, можуть функціонувати як альтернативні ФТ. У наведеній роботі ця методологія була застосована для аналізу характерних профілів експресії міРНК різних В-лімфопроліферативних і мієлопроліферативних захворювань. Виявлено такі основні закономірності: 1) значна частина пре-міРНК, залучених до патогенезу різних гематологічних захворювань, містить комплементарні мотиви до сайтів зв’язування ФТ c-myc і NF-kB-p50. Відповідно, елементи деградому таких пре-міРНК потенційно здатні функціонувати як альтернативні ФТ; 2) кожній нозологічній формі властивий певний характерний спектр ФТ-комплементарних мотивів у її профілі експресії міРНК, що свідчить про їх реальну участь у механізмах диференціювання клітин; 3) різні типи інформаційної надлишковості пре-міРНК відповідають різним напрямкам диференціювання клітин. Одержані результати дають змогу також сформулювати такі рекомендації для диференційної діагностики: 1) гіперекспресія miR-320a та miR-323b у бластних клітинах може бути вагомим аргументом для діагностики хронічної мієлоцитарної лейкемії; 2) гіперекспресія miRs 495 та 543 — сама по собі або, тим більше, у комбінації з гіпоекспресією miR-134, -542, -623, -671, -1182 — у бластних клітинах може бути вагомим аргументом для діагностики хронічної мієлоцитарної лейкемії; 3) гіпоекспресія miR-126 у бластних клітинах може бути вагомим аргументом для діагностики гострої мієлоцитарної лейкемії; 4) гіперекспресія miR-185 та miR-324 у клітинах лімфоми може бути вагомим аргументом для діагностики лімфоми Беркітта; 5) гіперекспресія miR-192a-2 у клітинах лімфоми може бути вагомим аргументом для діагностики мантійно-клітинної лімфоми Дод.точки доступу: Orlovsky, O. A. Samoylenko, O. A. Вільних прим. немає