Вторинний метаболом і транскриптом STREPTOMYCES ALBUS J1074 в рідкому середовищі SG2 / О. Т. Кошла [та ін.] // Цитология и генетика. - 2019. - Том 53, N 1. - С. 3-10


MeSH-головна:
СТРЕПТОМИЦЕТЫ -- STREPTOMYCES (генетика, метаболизм)
ВТОРИЧНЫЙ ОБМЕН ВЕЩЕСТВ -- SECONDARY METABOLISM (генетика)
Анотація: Streptomyces albus J1074 – одна із найпопулярніших платформ для гетерологічної експресії актинобактерійних біосинтетичних генних кластерів (BGCs). Докладають значних зусиль, аби зрозуміти всі фізіологічні та генетичні аспекти вторинного метаболізму J1074, з тим щоб максимізувати експресію гетерологічних BGCs. Слід відзначити, що геном J1074 містить багато (20) BGCs, експресія яких значно варіює. Отже, ідентифікація факторів, що обмежують вияв BGCs в J1074 можуть допомогти покращити цей штам для потреб гетерологічної експресії. Як перший крок в цьому керунку нами описано вторинний метаболом 1074 в рідкому середовищі SG2, що, як показано нами раніше, підтримує продукцію протибактерійних і протигрибкових сполук. Ми порівнюємо метаболомні дані з транскриптомом J1074 в SG2 на 60 год росту. Результати наших досліджень обговорено в контексті поточного розуміння метаболомних і транскриптомних даних для штаму J1074
Streptomyces albus J1074 is one of the most popular chassis for heterologous expression of actinobacterial biosynthetic gene clusters (BGCs). Considerable efforts are invested into understanding all the physiological and genetic aspects of secondary metabolism of J1074 in order to maximize the expression of heterologous BGCs. It has to be noted that the J1074 genome itself is home to numerous (20) BGCs, whose expression varies widely. Therefore, the identification of the factors limiting the expression of J1074 BGCs might help improve this strain for heterologous expression purposes. As first steps towards this goal, herein we describe the secondary metabolome of J1074 in liquid medium SG2, previously shown by us to support the production of antibacterial and antifungal compounds. We compare the results of metabolomic studies with the transcriptome of J1074 in SG2 after 60 h of growth. Results of our studies are discussed in the context of current knowledge on the J1074 transcriptome and metabolome data
Дод.точки доступу:
Кошла, О. Т.
Рокицький, І. В.
Осташ, І. С.
Буше, Т.
Каліновскі, Й.
Мьоскер, Є.
Зюсмут, Р. Д.
Федоренко, В. О.
Осташ, Б. О.

Вільних прим. немає