Клочко, В. В. Полифазный таксономический анализ и биологически активные вещества штамма Pseudomonas sp. 2303 [Текст] / В. В. Клочко, К. О. Чугунова, Л. В. Авдеева // Мікробіологічний журнал. - 2018. - Том 80, N 3. - С. 29-39 MeSH-головна: ПСЕВДОМОНАДЫ -- PSEUDOMONAS (генетика) ДНК ШТРИХ-КОДИРОВАНИЕ ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ -- DNA BARCODING, TAXONOMIC (методы) ОСНОВАНИЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ -- BASE SEQUENCE (генетика) ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ АНАЛИЗ -- SEQUENCE ANALYSIS (методы) Анотація: Визначення таксономічного статусу штаму Pseudomonas sp. 2303 і вивчення його біологічної активності. Методи. Виділення бактеріальної ДНК, ампліфікація і сіквенс гена 16S рРНК, вивчення культуральних, морфологічних, фізіолого-біохімічних властивостей і антагоністичної активності. Трансмісійна електронна мікроскопія, газова хромато-мас-спектрометрія. Результати. Філогенетичний аналіз послідовності гена 16S рРНК штама Pseudomonas sp. 2303 (1334 п.н.) і представників роду Pseudomonas виявив 100 % ідентичності з геном типового штаму P. synxantha АТСС 9890Т, а також з флюоресціюючими видами P. gessardii і P. libanensis. Останні відрізнялися від досліджуваного штаму за своїми фенотиповими властивостями. Жирнокислотний аналіз показав, що до складу Pseudomonas sp. 2303 входять характерні для псевдомонад C16:0, C16:1, C18:1, 2OHC12:0 кислоти, вміст яких був подібний до такого ж у типового штаму P. synxantha. Штам Pseudomonas sp. 2303 характеризувався високою антагоністичною активністю по відношенню до бактерій і грибів. Висновки. На основі результатів поліфазного таксономічного аналізу штам Pseudomonas sp. 2303 було віднесено до виду P. synxantha і включено в Українську колекцію мікроорганізмів як P. synxantha УКМ В-399 (сіквенс задепоновано в Genbank під номером MF196188). Запропоновано ряд діагностичних ознак (синтез феназин-1-карбонової кислоти, нездатність до утворення левану з сахарози, засвоєння деяких джерел вуглецю), які дають змогу відрізняти вид P. synxantha від близькоспоріднених йому видів. Дод.точки доступу: Чугунова, К. О. Авдеева, Л. В. Вільних прим. немає |