Данкевич, Л. А. Генетичне профілювання фітопатогенних бактерій роду Pseudomonas — збудників мокрого водянистого гниття люпину [Текст] / Л. А. Данкевич, В. П. Патика> // Мікробіологічний журнал. - 2018. - Том 80, N 3. - С. 53-65 MeSH-головна: РАСТЕНИЙ БОЛЕЗНИ -- PLANT DISEASES (микробиология) ЛЮПИН -- LUPINUS (микробиология) ПСЕВДОМОНАДЫ -- PSEUDOMONAS (генетика, патогенность) ФИЛОГЕНЕЗ -- PHYLOGENY ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ГЕТЕРОГЕННОСТЬ -- GENETIC HETEROGENEITY Анотація: Мета. Для коректної видової ідентифікації та оцінки групової гетерогенності було проведено фінгепринтування геномів ізольованих нами Pseudomonas sp., колекційних штамів "Pseudomonas xanthochlora", а також типових представників виду Pseudomonas marginalis та п’яти біоварів виду Pseudomonas fuorescens. Методи. В ході досліджень було використано мікробіологічні, молекулярно-генетичні (REP-ПЛР) методи та методи молекулярної філогенетики (UPGMA). Результати. Оцінена генетична гетерогенність ізольованих Pseudomonas sp. та колекційних "Pseudomonas xanthochlora" штамів. Встановлено значну спорідненість ізольованих Pseudomonas sp. і колекційних "Pseudomonas xanthochlora" штамів із типовим штамом Pseudomonas marginalis pv. marginalis 9175[[p]]T[[/p]] за BOX, REP та ERIC-профілями. Висновки. BOX, ERIC і REP-профілювання геному збудника мокрого водянистого гниття люпину виявило незначну генетичну гетерогенність даної групи штамів (від 6 до 9 % гетерогенності) та близьку їх спорідненість з представниками виду Pseudomonas marginalis (94 ? 91 % гомології BOX, ERIC і REP-профілів). Подібність результатів BOX і ERIC-профілювання геному збудника мокрого водянистого гниття люпину може бути корисною для швидкої коректної діагностики даного збудника, особливо, у випадку масового ураження рослин. Дод.точки доступу: Патика, В. П. Вільних прим. немає |