Полищук, Л. B. Гомологичность первичной структуры бета-галактозидазного гена Streptomyces globisporus 1912 и аналогичных генов стрептомицетов [Текст] / Л. B. Полищук, О. И. Бамбура // Мікробіологічний журнал. - 2019. - Том 81, N 2. - С. 41-50 MeSH-головна: ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ГОМОЛОГИЯ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ -- SEQUENCE HOMOLOGY, NUCLEIC ACID СТРЕПТОМИЦЕТЫ -- STREPTOMYCES (генетика) БЕТА-ГАЛАКТОЗИДАЗА -- BETA-GALACTOSIDASE (генетика) ДНК ШТРИХ-КОДИРОВАНИЕ ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ -- DNA BARCODING, TAXONOMIC (методы) Анотація: Мета даного дослідження – визначити ступінь гомології нуклеотидних послідовностей ?-галактозидазних генів ряду штамів стрептоміцетів і гена S. globisporus 1912, що кодує ?-галактозидазу. Аналізували геноми 30 штамів стрептоміцетов з різним ступенем таксономічної спорідненості S. globisporus 1912. Порівняльний BLAST аналіз первинних структур геномів 31 стрептоміцета з баз даних «Nucletide collection» і «Whole-genome shotgun contigs» на сервері NCBI проводили за допомогою програм (blastn і bl2sеq) з пакету BLAST. Результати. BLAST aналізом встановлено значну ступінь гомології (від 66% до 97%) послідовностей бета-галактозидазних генів більшості (90%) досліджених штамів стрептоміцетов аналогічному гену S. globisporus 1912-4Сrt. З них тільки первинні структури бета-галактозидазних генів штамів – членів S. albovinaceus субклади мали ступінь гомології їх структур референсному гену вище 95,5%. Встановлено, що в геномах штамів з представленої довільної вибірки присутні до 6 бета-галактозидазних генів. Однак у більшості (51,6%) штамів в геномі присутні по одному бета-галактозидазному гену, у 3 з них структури бета-галактозидазних генів не мають гомології зі структурою референсного гена S. globisporus 1912-4Сrt. Висновки. Гомологічність первинних структур бета-галактозидазних генів штамів стрептоміцетів і аналогічного гена S. globisporus 1912-4Сrt залежить від таксономічної їх генетичної спорідненості штаму S. globisporus 1912. Наприклад, первинні структури бета-галактозидазних генів штамів – членів S. albovinaceus субклади були найбільш гомологічними структурі референсного гена (вище 95,5%). Дод.точки доступу: Бамбура, О. И. Вільних прим. немає |