Данкевич, Л. А.
    REP-ПЛР аналіз бактерій роду Erwinia - збудників хвороб яблуні в Україні [Текст] / Л. А. Данкевич, Ф. В. Мучник, В. П. Патика // Мікробіологічний журнал. - 2019. - Том 81, N 6. - С. 45-57


MeSH-головна:
РАСТЕНИЙ БОЛЕЗНИ -- PLANT DISEASES (микробиология)
ЯБЛОНЯ -- MALUS (микробиология)
ЭРВИНИИ -- ERWINIA (генетика)
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ГЕТЕРОГЕННОСТЬ -- GENETIC HETEROGENEITY
Анотація: Мета. Для коректної видової ідентифікації та оцінки групової гетерогенності було проведено фінгепринтування геномів ізольованих нами Erwinia sp., колекційних Erwinia horticola штамів та типового штаму Erwinia amylovora УKM В-9057[[p]]Т[[/p]]. Методи. В ході досліджень було використано мікробіологічні, молекулярно-генетичні (RЕР-ПЛР) та статистичні (UPGMA) методи. Результати. Оцінена генетична гетерогенність ізольованих Erwinia sp., колекційних Е. horticola штамів. Встановлено значну спорідненість ізольованих Erwinia sp. штамів із типовим штамом Е. amylovora УКМ В-9057[[p]]Т[[/p]] за BOX, REP та ERIC профілями. Виявлено гетерогенність колекційних штамів Е. horticola за даною ознакою. Висновки. Вперше в Україні проведено BOX, REP та ERIC профілювання бактерій роду Erwinia, що викликають хвороби яблуні. Встановлена відсутність гетерогенності геномних фінгерпринтів (100% ідентичності) ізольованих нами штамів Erwinia sp. і їх спорідненість з аналогічними, отриманими для типового штаму Е. amylovora УКМ В 9057[[p]]Т[[/p]]. Аналогічні профілі колекційних штамів Е. horticola споріднені з профілями Е. amylovora УКМ В-1095[[p]]Т[[/p]] на 85-92% (ВОХ-ПЛР), 78-89% (REP-ПЛР) та 64~100% (ERIC-ПЛР) відповідно. Отримані нами результати можуть бути використані для моніторингу розповсюдження даних збудників та ідентифікації окремих штамів у дослідженнях з популяційної генетики, філогенетики та біогеографії.
Дод.точки доступу:
Мучник, Ф. В.
Патика, В. П.

Вільних прим. немає