Ecological aspect of antibiotic batumin synthesis by Pseudomonas batumici [Text] / V. V. Klochko [et al.] // Мікробіологічний журнал. - 2021. - Том 83, N 3. - P14-23 MeSH-головна: ПСЕВДОМОНАДЫ -- PSEUDOMONAS (выделение и очистка) АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫЕ СРЕДСТВА -- ANTI-BACTERIAL AGENTS (биосинтез) КУЛЬТУРАЛЬНЫЕ СРЕДЫ -- CULTURE MEDIA (химия) ХРОМАТОГРАФИЯ ТОНКОСЛОЙНАЯ -- CHROMATOGRAPHY, THIN LAYER (использование) PECTOBACTERIUM CAROTOVORUM -- PECTOBACTERIUM CAROTOVORUM (патогенность, рост и развитие) PSEUDOMONAS SYRINGAE -- PSEUDOMONAS SYRINGAE (патогенность, рост и развитие) PSEUDOMONAS FLUORESCENS -- PSEUDOMONAS FLUORESCENS (патогенность, рост и развитие) Анотація: Вид Pseudomonas batumici, виділений з ризосфери евкаліпта у вологій субтропічній зоні, є продуцентом полікетидного антибіотика батуміну з високою селективною активністю щодо стафілококів. Згідно наших даних повного сиквенсу геному штаму P. batumici УКМ В-321, за біосинтез батуміну відповідає значна частина геному, яка містить 28 генів або близько 70000 пар нуклеотидів. Згідно сучасних уявлень, біосинтез енергетично затратних метаболітів, до яких, ймовірно, відноситься і батумін, виправдовує себе у випадку своєї поліфункціональності для продуцентів. Оскільки вид P. batumici є представником ризосферних бактерій – актуальним є дослідження ролі батуміну у взаємодії з рослинами та оточуючою мікробіотою. Мета. Встановити роль батуміну в екології ризосферного штаму-продуцента P. batumici УКМ В-321. Методи. Предметом дослідження був антибіотик батумін, синтезований штамом P. batumici УКМ В-321 та близькі йому за структурою мінорні компоненти, утворювані в процесі біосинтезу. Культуральну рідину штаму, отриману в умовах глибинного культивування, екстрагували хлороформом (1:2). Похідні батуміну отримували методом тонкошарової хроматографії, використовуючи силікагельні пластини (Merck, USA) в системі бензол: ізопропанол – 5:1; проявник – пари йоду. Аналіз отриманих сполук та визначення їх молекулярних мас проводили методом високоефективної рідинної хроматографії (Agilent 1200) із застосуванням мас-спектрометричного детектору (Agilent G1956B): колонка SB-C18 (Zorbax), рухома фаза – ацетонітрил: вода (55:45), температура колонки – 30 C, швидкість потоку – 1 мл/хв, ізократичний режим, інжекція – 5 мкл; іонізація методом APCI. Для біоавтографії отриманих сполук і визначення мінімальної пригнічуючої концентрації (МПК) використовували тест-штами бактерій з Української колекції мікроорганізмів та відділу фітопатогенних бактерій ІМВ НАН України. Біоплівкоутворення вивчали методом O’Toole на поживному середовищі LB. Як барвник використовували генціанвіолет (BioMerieux, France). Для оцінки рівня утворення біоплівки штамом P. batumici УКМ В-321 застосовували фотометричне визначення за допомогою сканеру для планшет Multiskan FC (Thermo Fisher Scientific, USA); довжина хвилі 540 нм. Вплив антибіотика батуміну на рухливість бактерій вивчали на чашках Петрі з напіврідким агаром, додаючи різні концентрації антибіотика: 10, 25 і 32 мкг/мл. Як тест-штам використовували Proteus vulgaris УКМ B-905. Додатково використовували метод світлової мікроскопії, препарат «висяча крапля» та світловий мікроскоп «Мікмед-1». Хемотаксис вивчали методом Tso і Adler, вимірюючи зони на чашках Петрі. Ефектором слугував антибіотик батумін в концентраціях 20, 50 і 150 мкг/мл; тест-штам Bacillus subtilis УКМ B-7023. Висновки. Встановлені особливості дозволяють розглядати утворюваний P. batumici УКМ В-321 антибіотик батумін як суттєвий інструмент виживання і конкурентної боротьби штама-продуцента в природних умовах. Дод.точки доступу: Klochko, V. V. Lipova, I. I. Chuiko, N. V. Avdeeva, L. V. Вільних прим. немає