Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Романовская В. А., Белькова Н. Л., Парфенова В. В., Гладка Г. В., Мучник Ф. В., Таширев А. Б.
Назва : Филогенетический анализ коллекционных штаммов метанокисляющих бактерий
Місце публікування : Мікробіологічний журнал. - К., 2017. - Том 79, N 2. - С. 3-12 (Шифр МУ14/2017/79/2)
MeSH-головна: METHYLOCOCCACEAE -- METHYLOCOCCACEAE
ФЕНОТИП -- PHENOTYPE
КЛАСТЕРНЫЙ АНАЛИЗ -- CLUSTER ANALYSIS
ДНК ШТРИХ-КОДИРОВАНИЕ ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ -- DNA BARCODING, TAXONOMIC
СЕКВЕНИРОВАНИЕ ДНК -- SEQUENCE ANALYSIS, DNA
Анотація: Цель. Провести филогенетический анализ и уточнить таксономическое положение коллекционных штаммов метан окисляющих бактерий (метанотрофов). Методы. Объекты исследования — 22 штамма облигатных метанотрофов, которые хранились в Украинской коллекции микроорганизмов (УКМ). Морфолого-физиологические свойства бактерий изучали стандартными методами. Путь ассимиляции метана устанавливали, определяя в бесклеточных экстрактах метанотрофов ключевые ферменты метаболизма С[[d]]1[[/d]]-соединений. Филогенетическое положение определяли построением дендрограмм на основе генов 16S рРНК метанотрофов, показывающих положение изучаемого штамма среди близкородственных и типовых видов (пакеты программ ClustalX 2.1, Mega v. 6.00) с использованием метода ближайших соседей. Результаты. Исследованные штаммы представлены семействами Methylococcaceae (род Methylobacter) и Methylocystaceae (рода Methylocystis и Methylosinus). Учитывая результаты филогенетического анализа и их фенотипические свойства, они отнесены к видам Methylobacter marinus (5 штаммов), М. luteus (1 штамм), Methylosinus trichosporium (3 штамма), Methylocystis rosea (2 штамма), М. hirsuta (1 штамм). На филогенетическом дереве девять исследованных штаммов Methylobacter образовали два отдельных кластера, которые отличаются также по фенотипическим признакам от известных видов и поэтому могут представлять новые виды. Выводы. Филогенетический и фенотипический анализы позволили уточнить таксономическое положение 22-х коллекционных штаммов метанотрофов.
Дод.точки доступу:
Романовская, В. А.
Белькова, Н. Л.
Парфенова, В. В.
Гладка, Г. В.
Мучник, Ф. В.
Таширев, А. Б.