Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Полищук Л. В., Лукьянчук В. В.
Назва : Определение близкородственных связей штамма Streplomyces globisporus 1912-2
Місце публікування : Мікробіологічний журнал. - К., 2017. - Том 79, N 4. - С. 53-65 (Шифр МУ14/2017/79/4)
MeSH-головна: СТРЕПТОМИЦЕТЫ -- STREPTOMYCES
МУЛЬТИЛОКУСНОЕ ТИПИРОВАНИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ -- MULTILOCUS SEQUENCE TYPING
МОЛЕКУЛЯРНОЕ ТИПИРОВАНИЕ -- MOLECULAR TYPING
ДНК ШТРИХ-КОДИРОВАНИЕ ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ -- DNA BARCODING, TAXONOMIC
Анотація: Цель работы — определить близкородственные связи штамма Streptomyces globisporus 1912-2 и установить систематическую группу низшего уровня (кладу), к которой относится данный штамм. Методы. In silico анализ первичных структур геномов штамма S. globisporus 1912-2 и штаммов Streptomvces spp. из базы данных «Genome» сервера National Center for Biotechnology Information проводился с помощью программ пакета Basic Local Alignment Search Tool указанного сервера. Результаты. Определено близкое родство штамма S. globisporus 1912-2 со штаммами S. griseus клады. В результате in silico анализа суммарных первичных структур геномов стрептомицетов базы данных «Genome» и указанного штамма, как и в результате сравнения нуклеотидных последовательностей их 16S рРНК-генов, установлено наибольшее родство со штаммам S. globisporus С-1027. Однако анализ in silico последовательностей 6 генов штаммов стрептомицетов выявил наибольшее родство штамма S. globisporus 1912-2 со штаммом S. griseus NBRC13350. Выводы. Установлено, что изучаемый штамм S. globisporus 1912-2 является членам S. griseus клады.
Дод.точки доступу:
Лукьянчук, В. В.