Форма документа : Стаття із журналу Шифр видання : Автор(и) : Shtenikov M. D., Ostapchuk A. M., Vasylieva N. Y., Luzhetskyy A. M., Ruckert C., Kalinowski J., Ivanytsia V. O. Назва : Characteristics of genome of Bacillus velezensis ONU 553 strain isolated from the bottom sediments of the Black Sea Місце публікування : Мікробіологічний журнал. - К., 2020. - Том 82, N 3. - С. 14-21 (Шифр МУ14/2020/82/3) MeSH-головна: БАЦИЛЛЫ -- BACILLUS АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫЕ СРЕДСТВА -- ANTI-BACTERIAL AGENTS ПОВЕРХНОСТНО-АКТИВНЫЕ ВЕЩЕСТВА -- SURFACE-ACTIVE AGENTS БАКТЕРИОЦИНЫ -- BACTERIOCINS Анотація: Пошук продуцентів біологічно активних метаболітів зміщується в напрямку дослідження штамів з екзотичних біотопів. Аеробні спороутворюючі бактерії з донних відкладень Чорного моря є добрим прикладом таких мікроорганізмів завдяки легкості селективного виділення, підтримання в культурі та високій біосинтетичній активності. Мета. Проаналізувати структуру генома антагоністично активного штаму Bacillus sp. ONU 553, ізольованого з донних осадів Чорного моря, для його реідентифікації та виявлення генів, що відповідають за синтез біологічно активних сполук. Методи. Отриману геномну ДНК було секвеновано з використанням секвенатору НiSeq 1500 (Illumina). Збірку геному здійснено з використанням асемблеру Newbler версії 2.8, визначення видової належності штаму – за допомогою сервера TYGS, підрахунок ANI – з використанням Ezbiocloud. Анотування геному здійснено за допомогою серверів PATRIC та NCBI PGAP, пошук кластерів біосинтезу антибіотиків та бактеріоцинів – за допомогою antiSMASH та Bagel4 відповідно. Пошук детермінант патогенності виконувався за допомогою IslandViewer, резистентності до антибіотиків – ResFinder-3.2, пошук профагових елементів – з використанням PHASTER. Результати. Встановлено, що розмір дослідженого геному сягає 3 934 563 пар основ, вміст ГЦ-пар складає 46,69%. Виявлено 3 953 відкриті рамки зчитування, з них ідентифіковано 3 252 (82%). Виявлено детермінанти шести антибіотиків і двох бактеріоцинів, а також чотири профаг-подібних елементи. Висновки. Проведені дослідження та порівняльний аналіз геному штаму Bacillus sp. ONU 553, ізольованого з донних осадів Чорного моря, дають підстави підтвердити його ідентифікацію до виду Bacillus velezensis та роблять перспективним його подальше дослідження як потенційного пробіотика та джерела нових біологічно активних метаболітів. Дод.точки доступу: Shtenikov, M. D. Ostapchuk, A. M. Vasylieva, N. Y. Luzhetskyy, A. M. Ruckert, C. Kalinowski, J. Ivanytsia, V. O.