Вид документа : Статья из журнала Шифр издания : Автор(ы) : Патыка Н. В., Колодяжный А. Ю., Ибатуллин И. И. Заглавие : Оценка метагенома и детекция функционально значимых полиморфизмов прокариот почвы с использованием метода пиросеквенирования Место публикации : Мікробіол. журн. - К., 2016. - Т. 78, № 2. - С. 43-51 (Шифр МУ14/2016/78/2) MeSH-главная: ПОЧВЫ МИКРОБИОЛОГИЯ -- SOIL MICROBIOLOGY МЕТАГЕНОМ -- METAGENOME ПРОКАРИОТНЫЕ КЛЕТКИ -- PROKARYOTIC CELLS Аннотация: В работе проведена оценка метагенома и функционально значимых филогенетических и таксономических полиморфизмов прокариот в черноземе типичном под пшеницей озимой с использованием метода пиросеквенирования. Было выявлено 1708 операционных таксономических единиц и 335 таксонов прокариот. Установлено, что в структуре метагенома прокариот чернозема типичного были представители 2 архейных и 22 бактериальных фил, абсолютные доминанты относились к Proteobacteria – 79,6 % и Actinobacteria – 12,9 %. Полиморфизм представленности прокариотных таксонов наблюдали на уровне семейств; доминирующими при этом были: Alcaligenaceae, Pseudomonadaceae, Solirubrobacteraceae, Gaiellaceae, Nitrososphaeraceae. Показано филогенетические связи между основными представителями метагенома прокариот, сформировавшиеся в черноземе типичном агроценоза пшеницы озимой. Таким образом, использование метода пиросеквенирования, кроме оценки структуры и разнообразия, открывает перспективы для исследования функциональной составляющей метагенома прокариот почвы. Доп.точки доступа: Колодяжный, А. Ю. Ибатуллин, И. И.