Вид документа : Статья из журнала Шифр издания : Автор(ы) : Романовская В. А., Белькова Н. Л., Парфенова В. В., Гладка Г. В., Мучник Ф. В., Таширев А. Б. Заглавие : Филогенетический анализ коллекционных штаммов метанокисляющих бактерий Место публикации : Мікробіологічний журнал. - К., 2017. - Том 79, N 2. - С. 3-12 (Шифр МУ14/2017/79/2) MeSH-главная: METHYLOCOCCACEAE -- METHYLOCOCCACEAE ФЕНОТИП -- PHENOTYPE КЛАСТЕРНЫЙ АНАЛИЗ -- CLUSTER ANALYSIS ДНК ШТРИХ-КОДИРОВАНИЕ ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ -- DNA BARCODING, TAXONOMIC СЕКВЕНИРОВАНИЕ ДНК -- SEQUENCE ANALYSIS, DNA Аннотация: Цель. Провести филогенетический анализ и уточнить таксономическое положение коллекционных штаммов метан окисляющих бактерий (метанотрофов). Методы. Объекты исследования — 22 штамма облигатных метанотрофов, которые хранились в Украинской коллекции микроорганизмов (УКМ). Морфолого-физиологические свойства бактерий изучали стандартными методами. Путь ассимиляции метана устанавливали, определяя в бесклеточных экстрактах метанотрофов ключевые ферменты метаболизма С[[d]]1[[/d]]-соединений. Филогенетическое положение определяли построением дендрограмм на основе генов 16S рРНК метанотрофов, показывающих положение изучаемого штамма среди близкородственных и типовых видов (пакеты программ ClustalX 2.1, Mega v. 6.00) с использованием метода ближайших соседей. Результаты. Исследованные штаммы представлены семействами Methylococcaceae (род Methylobacter) и Methylocystaceae (рода Methylocystis и Methylosinus). Учитывая результаты филогенетического анализа и их фенотипические свойства, они отнесены к видам Methylobacter marinus (5 штаммов), М. luteus (1 штамм), Methylosinus trichosporium (3 штамма), Methylocystis rosea (2 штамма), М. hirsuta (1 штамм). На филогенетическом дереве девять исследованных штаммов Methylobacter образовали два отдельных кластера, которые отличаются также по фенотипическим признакам от известных видов и поэтому могут представлять новые виды. Выводы. Филогенетический и фенотипический анализы позволили уточнить таксономическое положение 22-х коллекционных штаммов метанотрофов. Доп.точки доступа: Романовская, В. А. Белькова, Н. Л. Парфенова, В. В. Гладка, Г. В. Мучник, Ф. В. Таширев, А. Б.