Бібліотека Вінницького національного медичного університету ім. М.І.Пирогова

Головна

Спрощенний режим

Відео-інструкція

Опис

Бази даних

Періодичні видання- результати пошуку

Вид пошуку

Періодичні видання

Зона пошуку

Знайдено у інших БД:

Книги (1)

Формат представлення знайдених документів:
повний	інформаційний	короткий

Відсортувати знайдені документи за:
автором	назвою	роком видання	типом документа

Пошуковий запит: (<.>S=Биология компьютерная<.>)

Загальна кількість знайдених документів : 13
Показані документи з 1 по 13

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Боринская С. А., Гельфанд М. С., Миронов А. А.
Назва : Компьютерная геномика: в поисках генов
Місце публікування : Химия и жизнь-XXI век. - Москва, 2001. - № 2. - С. 36-40 (Шифр 72231/2001/2)
MeSH-головна: БИОЛОГИЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ -- COMPUTATIONAL BIOLOGY
Знайти схожі

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Иванов А. С.
Назва : Основы вычислительной химии для медико-биологов: Лекция
Місце публікування : Биомедицинская химия/ РАМН. - М., 2005. - Т. 51, Вып.2. - С. 152-169 (Шифр БР35/2005/51/2)
Предметні рубрики: Химия
Биология компьютерная
Информатика медицинская компьютерная
Знайти схожі

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Иванов А. С., Веселовский А. В., Арчаков А. И.
Назва : Методы экспериментальной валидации потенциальных белков-мишеней для новых лекарственных средств: Обзор
Місце публікування : Биомедицинская химия/ РАМН. - М., 2005. - Т. 51, Вып.1. - С. 2-18 (Шифр БР35/2005/51/1)
Предметні рубрики: Геномика
Биология компьютерная
Биохимия
Знайти схожі

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Сергейко А. П., Степанчикова А. В., Соболев В. Н., Зотчев С. Б., Лагунин А. А., Филимонов Д. А., Поройков В. В.
Назва : Компьютерное конструирование поликетидов с заданными свойствами
Місце публікування : Биомедицинская химия. - 2007. - Т. 53, № 5. - С. 522-531 (Шифр БР35/2007/53/5)
Предметні рубрики: Биология компьютерная
Макролиды
Знайти схожі

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Пятницкий М. А., Лисица А. В., Арчаков А. И.
Назва : Предсказание взаимосвязанных белков методами сравнительной геномики in silico
Місце публікування : Биомедицинская химия. - 2009. - Т. 55, № 3. - С. 230-246 (Шифр БР35/2009/55/3)
Предметні рубрики: Биология компьютерная
Белки-- генет
Знайти схожі

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Назва : Експеримент "in silico"
Місце публікування : Фармацевт-практик. - 2015. - № 10. - С. 16-17 (Шифр ФУ17/2015/10)
MeSH-головна: БИОЛОГИЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ -- COMPUTATIONAL BIOLOGY
Знайти схожі

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Гарник Т. П., Скрыпнюк З. Д., Головаха М. А.
Назва : Терминология и основные принципы биоэнергоинформационной медицины
Місце публікування : Фітотерапія. Часопис. - Київ, 2018. - N 2. - С. 26-33 (Шифр ФУ16/2018/2)
MeSH-головна: БИОЛОГИЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ -- COMPUTATIONAL BIOLOGY
ЭНЕРГЕТИЧЕСКИЙ ОБМЕН -- ENERGY METABOLISM
ТЕРМИНОЛОГИЯ -- TERMINOLOGY
Анотація: Запропоноване нами розуміння термінології біоенергоінформаційної медицини знімає багато суперечностей в світосприйнятті, інтегрує сучасні наукові знання за інформацією і енергією в живих системах. Визначається, які саме системи організму працюють за загальними для живого і неживого законами обміну інформацією, визначаються хвороби обміну інформацією. Диференціюються поняття інформації та енергії.Предложенное нами понимание терминологии биоэнергоинформационной медицины снимает много противоречий в мировосприятии, интегрирует современные научные знания по информации и энергии в живых системах. Определяется, какие именно системы организма работают по общим для живого и неживого законам обмена информацией, определяются болезни обмена информацией. Дифференцируются понятия информации и энергии.
Знайти схожі

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Кривомаз Т.
Назва : Карты болезней — фармацевтика in silico
Місце публікування : Фармацевт практик. - 2018. - № 9. - С. 18-19 (Шифр ФУ17/2018/9)
MeSH-головна: БАЗЫ ДАННЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ -- DATABASES, GENETIC
КОМПЬЮТЕРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ -- COMPUTER SIMULATION
БИОЛОГИЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ -- COMPUTATIONAL BIOLOGY
БИОМЕДИЦИНСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ -- BIOMEDICAL RESEARCH
КРЕМНИЙ -- SILICON
АМИНОКИСЛОТЫ, ПЕПТИДЫ И БЕЛКИ -- AMINO ACIDS, PEPTIDES, AND PROTEINS
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ -- MOLECULAR FARMING
КЛАСТЕРНЫЙ АНАЛИЗ -- CLUSTER ANALYSIS
Ключові слова (''Вільн.індекс.''): интерактомика
Анотація: Колоссальные объемы накопившейся информации об активности генов, взаимодействиях молекул и реакциях метаболизма в человеческом организме все чаще структурируют в виде баз данных открытого доступа. Этому способствуют рост вычислительных мощностей компьютерной техники и разработка новых алгоритмов информационных технологий. На смену методологиям in vivo и in vitro пришли компьютерные модели in silico
Знайти схожі

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Кривомаз Т.
Назва : Программирование клеток
Місце публікування : Фармацевт практик. - 2018. - № 10. - С. 20-21 (Шифр ФУ17/2018/10)
MeSH-головна: ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД -- GENETIC CODE
БИОЛОГИЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ -- COMPUTATIONAL BIOLOGY
МОЛЕКУЛЯРНАЯ СТРУКТУРА -- MOLECULAR STRUCTURE
Анотація: Синтетическая биология не только помогает понять фундаментальные принципы организации и работы живых систем, но и пытается их контролировать. Современные биотехнологические методы позволяют создавать новые биосистемы для решения прикладных задач — от лечения заболеваний до реального управления здоровьем человека
Знайти схожі

10.

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Venger A. M., Venger O. O., Zaitsev A. S., Hruzevskyi O. A.
Назва : Modulation of structure and folding homologs of Amb a 6 allergen of ambrosia artemisiifolia
Місце публікування : Одеський медичний журнал. - Одеса, 2019. - N 2/3. - С. 4-7 (Шифр ОУ2/2019/2/3)
Примітки : Бібліогр.: с. 6-7
MeSH-головна: АЛЛЕРГЕНЫ -- ALLERGENS
БИОЛОГИЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ -- COMPUTATIONAL BIOLOGY
Ключові слова (''Вільн.індекс.''): ambrosia artemisiifolia
Анотація: Amb a 6 allergen of Ambrosia artemisiifolia is a ragweed allergen (a principle cause of late summer hayfever in North America and Europe). The weed has recently become spreading as a neophyte in Europe, while climate change may also affect on the growth of the plant and additionally may also influence pollen allergenicity. In Ukraine, the number of diseases caused by this allergen has recently increased. Still the three-dimensional structure of Amb a 6 allergen has been yet undescribed. The aims of our study were the modulation of the three-dimensional structure and the search of folding-homologs of Amb a 6 allergen of A. artemisiifolia by bioinformatics methods. Material and Methods. Template search with Blast and HHBlits has been performed by the SWISSMODEL template library. Models are built based on the target-template alignment using ProMod3. Coordinates which are conserved between the target and the template are copied from the template to the model. Insertions and deletions are remodelled using a fragment library. Side chains are then rebuilt. Finally, the geometry of the resulting model is regularized by a force field. In case loop modelling with ProMod3 fails, an alternative model is built with PROMOD-II. Results and Discussion. Three-dimensional structure of Amb a 6 allergen has been successfully built. As folding-homologs of Amb a 6 allergen the maize nonspecific-lipid transfer protein was found. This protein has ability to bind and transfer lipids. Information about the three-dimensional structure and partial analogy with nonspecific-lipid transfer protein may help to thoroughly understand the properties and the spatial configuration of Amb a 6 allergenAmb a 6 аллерген Ambrosia artemisiifolia является одной из главных причин аллергических заболеваний в Северной Америке и Европе. Структура данного аллергена неизвестна. Целью нашего исследования была модуляция трехмерной структуры и поиск фолдинговых гомологов аллергена Amb a 6 A. artemisiifolia биоинформатическими методами. Материал и методы. Моделирование структуры и поиск гомологов проводили при помощи программ SWISS-MODEL и ProMod3. Результаты и обсуждение. Создана трехмерная структура аллергена Amb a 6. В качестве фолдинговых гомологов аллергена Amb a 6 был обнаружен белок неспецифического переноса липидов кукурузы
Знайти схожі

11.

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Ковалевська Л. М., Матвєєва А. С., Кашуба О. В.
Назва : Використання методів біоінформатики для аналізу клітинних сигнальних шляхів
Місце публікування : Онкология. - Киев, 2020. - Том 22, N 3/4. - С. 129-134 (Шифр ОУ3/2020/22/3/4)
MeSH-головна: ЛЕЙКОЗ ЛИМФОЦИТАРНЫЙ ХРОНИЧЕСКИЙ B-КЛЕТОЧНЫЙ -- LEUKEMIA, LYMPHOCYTIC, CHRONIC, B-CELL
B-ЛИМФОЦИТЫ -- B-LYMPHOCYTES
БИОЛОГИЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ -- COMPUTATIONAL BIOLOGY
КЛЕТКИ -- CELLS
Анотація: Мета: провести пошук клітинних сигнальних шляхів, які змінено у трансформованих В-лімфоцитах при хронічному лімфолейкозі (ХЛЛ). Об’єкт і методи: аналiз функцiональних зв’язкiв (асоцiацiй) бiлкiв родини транскрипцiйних факторiв SMAD та родини STAT було проведено з використанням бази даних та алгоритму FunCoup. Результати: використовуючи алгоритм FunCoup для аналізу функціональних зв’язків протеїнів родин SMAD і STAT показано, що основну роль у цих клітинних сигнальних шляхах відіграють протеїни SMAD4 та STAT5А. У результаті аналізу стало очевидним, що ці сигнальні шляхи перетинаються зі шляхами, які регулюють структуру хроматину. Вірогідно, що саме неактивність цілих ділянок хроматину зумовлює неможливість транскрипції SMAD4- та STAT5-залежних генів у трансформованих В-клітинах при ХЛЛ
Знайти схожі

12.

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Kovalevska L. M., Malysheva T. A., Kalman S. S., Rozumenko A. V., Verbova L. V., Rozumenko V. D., Kashuba E. V.
Назва : Expression pattern of MRPS 18 family genes in gliomas
Місце публікування : Experimental Oncology. - К., 2021. - Том 43, N 3. - С. 204-208 (Шифр ЕУ12/2021/43/3)
MeSH-головна: ГЕННАЯ ЭКСПРЕССИЯ -- GENE EXPRESSION
ГЛИОМА -- GLIOMA
ГЛИОБЛАСТОМА -- GLIOBLASTOMA
БИОЛОГИЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ -- COMPUTATIONAL BIOLOGY
Анотація: To assess expression patterns of MRPS18 family genes in glioblastoma tissues and glioma cell lines. Materials and Methods: Expression of MRPS18 family genes was analyzed by quantitative polymerase chain reaction in glioma cell lines and glioblastoma specimens. A bioinformatic analysis of the publicly available data on the expression of these genes was also provided. Results: The genes of MRPS18 family show different expression patterns in glioblastomas and glioma cell lines. The highest levels of expression were found for MRPS18-2 at mRNA and protein levels in both glioblastomas and glioma cell lines; the lowest — for MRPS18-1 at mRNA level. Conclusions: The elevated levels of relative expression of the MRPS18-2 gene are characteristic for glioma tumor tissues and cell lines
Знайти схожі

13.

Форма документа : Стаття із журналу
Шифр видання :
Автор(и) : Кленіна О. В., Чабан Т. І.
Назва : Використання баз даних хемоінформатики та біоінформатики у процесах комп’ютерного конструювання ліків (огляд)
Паралельн. назви :Use of chemoinformatics and bioinformatics databases in the processes of computer-aided drug design (review)
Місце публікування : Фармацевтичний журнал. - 2023. - Т. 78, № 6. - С. 61-82 (Шифр ФУ3/2023/78/6)
Примітки : Бібліогр.: в кінці ст.
MeSH-головна: БИОЛОГИЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ -- COMPUTATIONAL BIOLOGY
БАЗЫ ДАННЫХ ФАРМАЦЕВТИЧЕСКИЕ -- DATABASES, PHARMACEUTICAL
Анотація: Впровадження методів комп’ютерного моделювання у процес розроблення лікарських засобів (computer-aided drug discovery – CADD) дає змогу мінімізувати час та вартість створення нових біологічно активних речовин порівнюючи з традиційними експериментальними підходами. Процес in silico розроблення ліків включає ідентифікацію біологічних мішеней для потенційних лікарських засобів та створення комбінаторних бібліотек низькомолекулярних сполук із подальшим проведенням їх віртуального скринінгу до обраних макромолекул. Такий підхід є можливим за наявності інформації про тривимірні хімічні структури лігандів та біомолекул. У цьому контексті бази даних хемоінформатики та біоінформатики є високоефективними ресурсами для використання на різних етапах процесу раціонального конструювання ліківМетою цього огляду став розгляд основних підходів у разі застосування методів молекулярного моделювання у процесі раціонального конструювання ліків, а також аналіз та узагальнення інформації про сучасні бази хемоінформатики та біоінформатики, які є у вільному доступі та широко використовуються на всіх етапах пошуку і розроблення потенційних лікарських засобів. У роботі використано комплекс загальнонаукових методів пошуку та систематизації джерел літератури, аналіз та порівняння інформації з різних джерел, узагальнення зі зазначенням тенденцій розвитку, виділення нових та перспективних напрямів досліджень. В огляді охарактеризовано основні сучасні хемоінформатичні та біоінформатичні бази даних, які є у вільному доступі. Ці інформаційні ресурси широко використовуються для проведення ліганд-орієнтованого та рецептор-орієнтованого віртуального скринінгу, що є основними підходами у процесі комп’ютерного конструювання ліків. Успіхи у розвитку органічного синтезу та високопродуктивного скринінгу, експериментальної біології, хімії та медицини, а також розроблення і запровадження нових підходів та інструментів хемоінформатики та біоінформатики, технологій обробки великих даних (Big Data) та досягнень інформаційних технологій створили підґрунтя для розроблення та швидкого наповнення високоефективних і структурованих баз даних. Ресурси баз даних хемоінформатики та біоінформатики, які є у вільному доступі, широко використовуються у процесах in silico розроблення та удосконалення потенційних лікарських засобівThe introduction of molecular modeling methods into the computer-aided drug discovery (CADD) process allows to minimize the time and costs for construction and development of new biologically active substances in comparison with traditional experimental approaches. In silico drug development process includes the identification of potential biological targets for drug candidates and the combinatorial libraries creation of low molecular weight compounds followed by their virtual screening to selected macromolecules. This approach becomes possible due to the availability of information about the three-dimensional chemical structures of ligands and biomolecules. In this context, freely available chemoinformatics and bioinformatics databases are the highly effective resources for use at various stages of the rational drug design processThe aim of this review was to consider the main approaches towards the application of molecular modeling methods in the process of rational drug discovery, as well as to analyse and summarize information concerning modern chemoinformatics and bioinformatics databases, which are freely available and widely used at all stages of the search and development of potential drug candidates. In the process of the review preparation we used a complex of general scientific methods of searching and systematizing literary references, analysis and comparison of information from various sources, generalization with the indication of development trends, selection of new and promising research directions. This review also describes the main modern freely available chemoinformatics and bioinformatics databases. These information resources are widely used for ligand-based and receptor-based virtual screening, which are the main approaches in the process of computer-aided drag design. Successes in the development of organic synthesis, high-throughput screening, experimental biology, chemistry, and medicine, as well as the development and implementation of new approaches and tools in chemoinformatics and bioinformatics, Big Data and information technologies achievements have created the basis for the development and increasing updating of highly efficient and curated databases. Freely available chemoinformatics and bioinformatics database resources are widely used in the processes of in silico discovery and improvement of potential drug candidate
Знайти схожі

© Міжнародна Асоціація користувачів і розробників електронних бібліотек і нових інформаційних технологій
(Асоціація ЕБНІТ)