Современные методы идентификации возбудителя гонококковой инфекции (обзор литературы) [Текст] / Н. В. Фриго [и др.] // Вестник дерматологии и венерологии. - 2011. - № 3. - С. 45-51 Рубрики: Гонорея--диагн Гонококки--выдел Нуклеиновой кислоты амплификации методы Микроскопия Дод.точки доступу: Фриго, Н. В. Полевщикова, С. А. Волков, И. А. Шаталова, А. Ю. Рахматулина, М. Р. Соломка, В. С. Вільних прим. немає |
REP-ПЛР аналіз збудників бактеріальних хвороб ріпаку [Текст] / Л. А. Данкевич [та ін.] // Мікробіологічний журнал : Наук. журн. - 2014. - № 4. - С. 17-25. - Библиогр. в конце ст. MeSH-головна: КРЕСТОЦВЕТНЫЕ -- BRASSICACEAE (классификация) РАСТЕНИЙ БОЛЕЗНИ -- PLANT DISEASES (микробиология, паразитология) НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ АМПЛИФИКАЦИИ МЕТОДЫ -- NUCLEIC ACID AMPLIFICATION TECHNIQUES (классификация, методы) Дод.точки доступу: Данкевич, Л. А. Захарова, О. М. Мельничук, М. Д. Воцелко, С. К. Патика, В. П. Вільних прим. немає |
Liu, Yonggang A colon cancer related gene-MLH1, significantly affecting the pig litter size / Yonggang Liu, Hongyu Chen // Цитология и генетика. - 2018. - Том 52, N 2. - P91-92 MeSH-головна: ГЕНЕТИКА ПОПУЛЯЦИОННАЯ -- GENETICS, POPULATION НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ АМПЛИФИКАЦИИ МЕТОДЫ -- NUCLEIC ACID AMPLIFICATION TECHNIQUES ГЕНЕТИЧЕСКОЙ КОМПЛЕМЕНТАЦИИ ТЕСТ -- GENETIC COMPLEMENTATION TEST СВИНЬИ -- SWINE Анотація: Гомолог MutL 1, асоційований з раком товстої кишки неполіпозного типу 2 (MLH1), – це пухлиноасоційований ген. У цьому дослідженні проведено клонування повнорозмірної послідовності кДНК гена MLH1 свиней за допомогою швидкої ампліфікації кінців кДНК (метод RACE). Ген MLH1 свиней кодує білок, що містить 757 амінокислот і має високий рівень гомології до MLH1 п’яти видів: чіру (96 %), овець (95 %), великої рогатої худоби (93 %), південних білих носорогів (92 %) та кіз (92 %). Цей новий ген свиней зареєстровано за GeneID:100337665. Філогенетичний аналіз виявив, що ген MLH1 свиней має тісний генетичний зв’язок з геном MLH1 південного білого носорога. Використання ПЦРПДРФ з HhaI дозволило виявити заміну GU373696:c.395 G A гена MLH1 свиней. Вісім порід свиней продемонстрували очевидні відмінності генотипів та частоти алелів у цьому локусі мутації. Нами оцінено зв’язок між цим однонуклеотидним поліформізмом (SNP) та розміром приплоду у популяціях свиней порід Велика біла (n = 200) та Ландрас (n = 200). Згідно з результатами цей поліморфічний локус суттєво пов’язаний з розміром приплоду у всіх випадках народжуваності свиней обох порід (P 0,01). Таким чином, MLH1 – це ген, який також пов’язаний з репродуктивністю Дод.точки доступу: Chen, Hongyu Вільних прим. немає |
Гармаш, О. В. Доцільність дослідження однонуклеотидних поліморфізмів генів ESR1 [rs2234693], CYP19A1 [rs2414096] та IL10 [rs1800896] як можливих маркерів ризику розвитку зубощелепних порушень в осіб, які народилися макросомами [Текст] / О. В. Гармаш, Э. М. Рябоконь // Патологія. - 2020. - Том 17, N 1. - С. 37-45 MeSH-головна: ПЛОДА МАКРОСОМИЯ -- FETAL MACROSOMIA (генетика, диагностика, этиология) ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНЕТИЧЕСКИЙ -- POLYMORPHISM, GENETIC (генетика) СТОМАТОГНАТИЧЕСКИЕ БОЛЕЗНИ -- STOMATOGNATHIC DISEASES (диагностика, лекарственная терапия, этиология) НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ АМПЛИФИКАЦИИ МЕТОДЫ -- NUCLEIC ACID AMPLIFICATION TECHNIQUES (использование) Анотація: Наведено аналіз впливу поліморфних варіантів CYP19A1 [rs2414096, rs936306], ESR1 [rs2234693, rs9340799], RANKL [rs9594738, rs9594759], IL1 [rs1143627], IL6 [rs1800796] та IL10 [rs1800896] генів на формування порушень зубощелепної системи в осіб, які народжені макросомами. Мета роботи – дослідити вплив поліморфних варіантів CYP19A1 [rs2414096, rs936306], ESR1 [rs2234693, rs9340799], RANKL [rs9594738, rs9594759], IL1 [rs1143627], IL6 [rs1800796] та IL10 [rs1800896] генів на розвиток зубощелепних порушень в осіб популяції Харківської та прилеглих областей, які народилися макросомами. Матеріали та методи. У багатоступеневе дослідження залучили 161 особу (144 особи – макросоми при народженні, 17 осіб, які народились нормосомами). Учасників дослідження поділили на групи за значенням їхнього дентального естетичного індексу (DAI), який характеризує тяжкість зубощелепних порушень і визначає потреби в ортодонтичному лікуванні. Результати. Помірні порушення прикусу (значення DAI 26–30 балів) в обстежених були асоційовані з варіантами генів ESR1 ([rs 2234693], наддомінантна модель успадкування), CYP19A1 ([rs2414096], адитивна, домінантна та мультиплікативна моделі успадкування) та IL10 ([rs1800896], наддомінантна модель успадкування). Поліморфізм гена IL10 [rs1800896] значущо пов’язаний із розвитком і помірних, і суттєвих порушень прикусу (наддомінантна модель успадкування). Протекція від істотних порушень прикусу (значення DAI 31–35 балів) асоційована з варіантом гена IL10 ([rs1800896], наддомінантна модель успадкування). За наявності гетерозиготного генотипу GA ризик розвитку порушень зменшувався у 6,7 раза. Аналіз варіантів генів ESR1 [rs 2234693], CYP19A1 [rs2414096] та IL10 [rs1800896], виконаний у дитячому віці, може бути основою для виявлення осіб групи ризику щодо формування порушень стоматогнатичної системи, а також для розроблення персоналізованих профілактичних заходів. Висновки. В осіб, які народилися макросомами, виявлена залежність стану стоматогнатичної системи від варіантів генів CYP19A1: A G [rs2414096], ESR1: -397 T C [PvuII], IL10: -1082 G A [rs1800896]. Дод.точки доступу: Рябоконь, Э. М. Вільних прим. немає |
Improving of the nested PCR for detection of bovine leukemia virus [Text] / I. M. Ishchenko [et al.] // Мікробіологічний журнал. - 2021. - Том 83, N 3. - P56-65 MeSH-головна: КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА БОЛЕЗНИ -- CATTLE DISEASES (диагностика) ЛЕЙКОЗА КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА ВИРУС -- LEUKEMIA VIRUS, BOVINE ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ -- POLYMERASE CHAIN REACTION (методы) ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ -- REAL-TIME POLYMERASE CHAIN REACTION (методы) НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ АМПЛИФИКАЦИИ МЕТОДЫ -- NUCLEIC ACID AMPLIFICATION TECHNIQUES (методы) ЭЛЕКТРОФОРЕЗ В АГАРОВОМ ГЕЛЕ -- ELECTROPHORESIS, AGAR GEL (методы) Анотація: Згідно з протоколом Всесвітньої організації охорони здоров’я тварин для діагностики лейкозу великої рогатої худоби методом полімеразної ланцюгової реакції необхідно застосовувати її гніздовий формат як найбільш чутливий. Однак висока чутливість одночасно є і її недоліком через високий ризик контамінації продуктами ампліфікації та, як наслідок – отримання псевдопозитивних результатів. Найбільш небезпечним етапом з огляду на контамінацію є електрофорез продуктів ампліфікації в агарозному гелі. Мета. Метою роботи було удосконалити гніздовий формат полімеразної ланцюгової реакції, який рекомендується протоколом Всесвітньої організації охорони здоров’я, шляхом проведення другої стадії методом полімеразної ланцюгової реакції в реальному часі, що дозволить зменшити ризик контамінації, оскільки не буде потреби у проведенні електрофорезу в агарозному гелі для інтерпретації результатів. Методи. Для першої стадії запропонованої модифікації полімеразної ланцюгової реакції було використано нуклеотидну послідовність праймерів, рекомендованих протоколом Всесвітньої організації охорони здоров’я тварин. Для другої стадії полімеразної ланцюгової реакції проведено дизайн праймерів та флуоресцентного зонду на основі аналізу нуклеотидних послідовностей ділянки оболонкового гену відомих ізолятів вірусу лейкозу, включаючи українські ізоляти. Крім того, для другої стадії було проведено дизайн праймерів для ідентифікації гену, специфічного для великої рогатої худоби, що дозволяє контролювати процес екстракції нуклеїнової кислоти у кожному зразку. Висновки. Запропонована нами модифікація гніздової полімеразної ланцюгової реакції поєднує в собі рекомендації Всесвітньої організації охорони здоров’я тварин щодо ідентифікації вірусу лейкозу за допомогою гніздової полімеразної ланцюгової реакції та зменшення ризику контамінації за рахунок проведення другої стадії в режимі реального часу, що є зручнішим у рутинній діагностиці. Крім того, ампліфікація гену, специфічного для великої рогатої худоби у запропонованій модифікації, дозволяє контролювати якість та кількість екстракції нуклеїнової кислоти та попереджати хибнонегативні результати дослідження. Дод.точки доступу: Ishchenko, I. M. Nedosekov, V. V. Ishchenko, V. D. Kepple, O. Yu. Tkachenko, V. V. Tkachenko, T. A. Midyk, S. V. Nemova, T. V. Melnychuk, S. D. Spyrydonov, V. G. Ushkalov, V. O. Вільних прим. немає |